Komplex III, tj. cytochrom bc, se skládá z Fe-S proteinu a ze dvou typů cytochromu b: b_L a b_H. Elektrony jdoucí z QH₂ na cyt c procházejí přes tzv. Q cyklus. Na Fe-S protein se přenese pouze jeden z elektronů QH₂ za vzniku radikálu QH*. Druhý elektron se přenese z QH* na cyt b_L za vzniku Q. Redukovaný Fe-S protein poté redukuje cyt c.
       Elektron z redukovaného cyt b_L se přenáší na cyt b_H, a poté na Q za vzniku radikálu QH*. Pro úplnou redukci na QH₂ je tedy zapotřebí ještě jeden cyklus.