Odbourávání glykogenu probíhá v játrech a ve svalu. Jedná se o fosforolýzu katalyzovanou enzymem fosforylasou. Aktivita enzymu je regulována proteinkinasou, která modifikuje serinový zbytek fosforylasy. Fosforylovaný enzym je aktivní. Odstranění fosfátové skupiny zajiuje enzym fosfatasa. Defosforylovaný enzym je inaktivní. Proteinkinasa samotná je regulována c-AMP, který vzniká na plasmatické membráně jaterních buněk (enzym adenylátcyklasa). Adenylátcyklasa je stimulována hormony adrenalinem a glukagonem. Interakce adrenalinu nebo glukagonu s buňkou stimuluje tedy odbourávání glykogenu.